Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC17■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms