Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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