Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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