Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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FgbQ8K0E8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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FgbQ8K0E8 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms