Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC5

Neurl3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl3Q8CJC5 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Neurl3Q8CJC5 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms