Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11fip3Q8CHD8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms