Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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