Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp27Q8CEG8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp27Q8CEG8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Usp27Q8CEG8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Usp27Q8CEG8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp27Q8CEG8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp27Q8CEG8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp27Q8CEG8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp27Q8CEG8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp27Q8CEG8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms