Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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