Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc38Q8CDN8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc38Q8CDN8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc38Q8CDN8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc38Q8CDN8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc38Q8CDN8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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