Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms