Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms