Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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