Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp44Q8C2S0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp44Q8C2S0 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp44Q8C2S0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp44Q8C2S0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp44Q8C2S0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp44Q8C2S0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp44Q8C2S0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Usp44Q8C2S0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp44Q8C2S0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms