Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms