Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Nek11Q8C0Q4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Nek11Q8C0Q4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Nek11Q8C0Q4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Nek11Q8C0Q4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Nek11Q8C0Q4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Nek11Q8C0Q4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Nek11Q8C0Q4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Nek11Q8C0Q4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Nek11Q8C0Q4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek11Q8C0Q4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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