Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0E3

Trim47, Tripartite motif-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim47Q8C0E3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim47Q8C0E3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim47Q8C0E3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim47Q8C0E3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim47Q8C0E3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim47Q8C0E3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim47Q8C0E3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim47Q8C0E3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim47Q8C0E3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim47Q8C0E3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim47Q8C0E3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim47Q8C0E3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim47Q8C0E3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim47Q8C0E3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim47Q8C0E3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim47Q8C0E3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim47Q8C0E3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim47Q8C0E3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim47Q8C0E3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim47Q8C0E3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim47Q8C0E3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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