Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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FarsaQ8C0C7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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FarsaQ8C0C7 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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FarsaQ8C0C7 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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FarsaQ8C0C7 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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FarsaQ8C0C7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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FarsaQ8C0C7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FarsaQ8C0C7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FarsaQ8C0C7 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FarsaQ8C0C7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FarsaQ8C0C7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms