Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms