Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms