Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tspan12Q8BKT6 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms