Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms