Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms