Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms