Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Ttc28Q80XJ3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ttc28Q80XJ3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Ttc28Q80XJ3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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Ttc28Q80XJ3 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
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Ttc28Q80XJ3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ttc28Q80XJ3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ttc28Q80XJ3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ttc28Q80XJ3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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