Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms