Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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