Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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