Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms