Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed3Q78IS1 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms