Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms