Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms