Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms