Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trim37Q6PCX9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trim37Q6PCX9 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trim37Q6PCX9 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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