Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
AtminQ6P9S1 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms