Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rrp12Q6P5B0 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rrp12Q6P5B0 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rrp12Q6P5B0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rrp12Q6P5B0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp12Q6P5B0 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp12Q6P5B0 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp12Q6P5B0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp12Q6P5B0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp12Q6P5B0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp12Q6P5B0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp12Q6P5B0 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp12Q6P5B0 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms