Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms