Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ctnna3Q65CL1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ctnna3Q65CL1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ctnna3Q65CL1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ctnna3Q65CL1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ctnna3Q65CL1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ctnna3Q65CL1 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ctnna3Q65CL1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ctnna3Q65CL1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ctnna3Q65CL1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ctnna3Q65CL1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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