Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Zfp248Q640N4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Zfp248Q640N4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Zfp248Q640N4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Zfp248Q640N4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Zfp248Q640N4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Zfp248Q640N4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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Zfp248Q640N4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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