Protein–RNA interactions for Protein: Q62170

Selplg, P-selectin glycoprotein ligand 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelplgQ62170 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SelplgQ62170 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms