Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
AcanQ61282 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AcanQ61282 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AcanQ61282 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AcanQ61282 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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