Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms