Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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