Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Cnot7Q60809 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Cnot7Q60809 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Cnot7Q60809 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Cnot7Q60809 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Cnot7Q60809 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Cnot7Q60809 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Cnot7Q60809 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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Cnot7Q60809 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Cnot7Q60809 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Cnot7Q60809 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Cnot7Q60809 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Cnot7Q60809 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms