Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stxbp3Q60770 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stxbp3Q60770 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stxbp3Q60770 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Stxbp3Q60770 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stxbp3Q60770 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stxbp3Q60770 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stxbp3Q60770 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stxbp3Q60770 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stxbp3Q60770 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stxbp3Q60770 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stxbp3Q60770 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stxbp3Q60770 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Stxbp3Q60770 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stxbp3Q60770 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stxbp3Q60770 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stxbp3Q60770 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stxbp3Q60770 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stxbp3Q60770 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stxbp3Q60770 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stxbp3Q60770 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stxbp3Q60770 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stxbp3Q60770 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stxbp3Q60770 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stxbp3Q60770 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stxbp3Q60770 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stxbp3Q60770 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stxbp3Q60770 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms