Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atf3Q60765 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms