Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms