Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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PtprnQ60673 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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PtprnQ60673 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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PtprnQ60673 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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PtprnQ60673 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PtprnQ60673 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PtprnQ60673 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PtprnQ60673 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PtprnQ60673 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PtprnQ60673 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PtprnQ60673 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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PtprnQ60673 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PtprnQ60673 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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PtprnQ60673 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms