Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms