Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Rnf123Q5XPI3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Rnf123Q5XPI3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Rnf123Q5XPI3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms